日前，中科院昆明動物研究所張亞平課題組利用二代測序技術對滇南小耳豬進行了全基因組測序，拓展了對家豬馴化過程中毛色變異調控機制的認識。目前這一研究成果已發表于學術期刊Scientific Reports上。
　　據介紹，家豬毛色表型常作為易察覺的外型特征，在品種選育中起重要作用。六白（四蹄、頭和尾尖白色）是家豬常見的毛色類型。之前有研究揭示歐洲家豬出現的六白毛色與MC1R基因的插入突變緊密相關，但對有著不同馴化起源的中國家豬來說，這一表型的形成機制至今并不清楚。在滇南小耳豬中，六白毛色比例較高，并且大量個體出現了不完全六白的特征，給該家豬品種的選育帶來了困難。
　　為解決這一科學問題，課題組利用二代測序技術，對17頭具有六白毛色表型和14頭全黑表型的滇南小耳豬進行了全基因組測序，利用比較基因組學分析手段并結合大規模群體基因分型驗證，從分子層面揭示了調控滇南小耳豬六白毛色的遺傳機制。研究結果顯示，滇南小耳豬的六白毛色并非由MC1R基因突變導致，而是受到多個基因共同調控的復雜性狀；CNTLN、PINK1和EDNRB三個基因的變異共解釋了滇南小耳豬群體中約20%的毛色表型變異。該研究拓展了對家豬馴化過程中毛色變異調控機制的認識，并對滇南小耳豬的選育具有指導意義。